Configuración MIDI con la ISIS
Esto es lo más sencillo, ya que sólo tenemos que seleccionar el puerto de entrada y de salida (o los puertos, si usas varios dispositivos, pero de momento vamos a lo básico). Va a depender de cada usuario; por ejemplo, si usas sintes software con puertos virtuales propios (Gigasampler, Reality) es otra historia, pero usando el sistema clásico (un teclado controlador como entrada y el sinte de la tarjeta como salida), tu configuración debería parecerse mucho a esa del gráfico.
Para editar los puertos, ve a Tools>MIDI Devices.
Por otra parte, un problema típico al usar Cakewalk es la selección de los bancos de sonido. Lo que pasa es que el modo de selección de bancos por defecto en el secuenciador es el Normal, y la ISIS utiliza el controlador cero para estas cosas. Para cambiarlo, pulsa con el botón derecho del ratón encima de la pista que vas a usar y ve a Track Properties. Una vez alli, pon el Bank Select Method en modo Controller 0.

Configuración audio con la ISIS
Para empezar a grabar con Cakewalk debes cubrir antes una serie de pasos. El primero es elegir la frecuencia de grabación, tanto en la Console 8/4 como en el propio Cakewalk; deben ser las mismas, o todo sonará de pena. Para esto, primero selecciona la frecuencia deseada en la Console 8/4 (los botones del Master clock, que pueden ser 32, 44 y 48 Khz) y luego ve a Cakewalk. En Tools>Audio Options (pestaña General, la primera que aparece), selecciona la misma frecuencia que antes en Default Sampling Rate.
El paso siguiente es activar la capacidad full-duplex del Cakewalk (si no, no podrás reproducir y grabar pistas al mismo tiempo). De nuevo en Tools>Audio Options, pero ahora en la pestaña Advanced, activa la casilla Enable simultaneous Record/Playback.
Todo listo. Ahora debes elegir en cada pista la entrada y la salida que quieres usar en la grabación y reproducción. Para esto, haz click con el botón derecho sobre la pista y selecciona Track Properties. De todos esos parámetros, sólo nos interesan por ahora el Source y el Port (entrada y salida del audio, respectivamente). Empecemos por el Source. La caja externa de la ISIS tiene 8 entradas mono agrupadas en 4 pares estéreo; es decir, la entrada 1 es el canal izquierdo del primer par estéreo, y la 2 el canal derecho. Por eso en este menú verás las entradas con nombres del estilo Left ISIS 1/2 Analog Record. Esta por ejemplo sería la entrada 1, y la Right ISIS 1/2 Analog Record sería la entrada 2. En el resto funciona de la misma manera; sólo hay que tener en cuenta que las entradas impares (1, 3, 5 y 7) son Left y las pares (2, 4, 6 y 8) son Right. En cuanto al Port, la elección es más sencilla: al no poder elegir cada salida por separado, habrás de seleccionar uno de los dos pares estéreo (la 1/2 o la 3/4).

Algunos procedimientos elementales
Si tienes todo listo, ahora sólo queda armar las pistas para grabar. Para esto, pulsa el boton R (el que está al lado de los botones de Solo y Mute). Se pondrá en rojo, lo que indica que está dispuesto para empezar. Prepara tu fuente de sonido (MIDI o audio) y dale al botón record... ¡grabando!
Los que están acostumbrados a un secuenciador sólo MIDI (aquellos que presentaban los compases con cuadritos o bolitas) pueden despistarse a la hora de editar las pistas en uno como éste. ¿Cómo se selecciona un compás en Cakewalk? Bien, en la ventana de pistas, una vez que tengas algo grabado, verás las típicas barras que indican dónde hay algo registrado, ya sean notas y eventos MIDI o una señal de audio. En el ejemplo de nuestro gráfico queríamos seleccionar los compases 2 y 3 de la pista de trompeta. Primero hemos seleccionado la pista a editar pulsando sobre el número de pista (está a la izquierda de todo, al lado del nombre). Con esto queda toda ella sombreada. Para elegir sólamente esos dos compases, basta con hacer click sobre el número de compás inicial, mantener pulsado el ratón, y arrastrarlo hasta el compás final. Ahora sólo están sombreados esos compases que queríamos: es el momento de cortar, borrar, copiar, añadir efectos o todo lo que se quiera con esa porción. Y si quieres editar esos mismos compases de otra pista a la vez (por ejemplo dos pistas que forman una sola señal estéreo), simplemente haz click en el número de la segunda (o tercaera, cuarta...) pista y ya lo tienes.
Para seleccionar todas las pistas de un golpe, haz doble click sobre el número de pista de cualquiera de ellas. Recuerda que los atajos de teclado para copiar (Control+C), cortar (Control+X) y pegar (Control+V) funcionan aquí como en cualquier otro programa de Windows. El de pegar tiene una función muy util: te permite especificar el número de veces que pegas un fragmento (ideal para loops). Se pegarán uno después de otro, consecutivamente.
Ahora repasemos un poco los parámetros de la ventana de pistas. Hemos seguido la presentación que hace Cakewalk Pro Audio 8.0, que debería ser muy similar al resto de versiones. Así, empezando por la izquierda, tenemos Name (permite elegir un nombre para cada pista; es recomendable ponerlo siempre porque podrías perderte si la canción es densa). Luego aparecen tres botones: M, S y R. M es el botón de Mute, para silenciar la pista, y S el de Solo, para hacer que únicamente suene esa pista y no las demás (aunque puedes ponder varias pistas en Solo). La R ya la hemos visto (es el botón de armar). Seguimos: ahora viene el Source, ya visto antes y que indica la fuente de entrada. Key + se utiliza para trasponer la pista completa (es el parámetro de afinación): imagina que tienes una canción en do mayor y quieres oirla en fa mayor. Pon el Key + en todas las pistas instrumentales (no las de percusión o efectos, evidentemente) a + 5 y ya está (cada unidad equivale a un semitono). El Vel + modifica la velocidad de pulsación de todas las notas de la pista (sonarán con más fuerza, o menos, según elijas). Ahora viene el Port, que como ya hemos dicho indica la salida de sonido. A continuación está el Chn, Bank y Patch. Con estos podrás seleccionar el instrumento que va a sonar en la pista. Ch es el canal (recuerda que hay 16 y el 10 es sólo para percusión), Bank el número de banco (imprescindible para usar archivos 94B) y Patch el número de instrumento (en General MIDI el 1 es Grand Piano, el 2 Bright Piano... usando un banco de sonido no GM la cosa cambia, claro). Después tenemos Vol y Pan. Vol indica el volumen al que sonará la pista, con un rango de 0 a 127. El Pan marca la panoramización de la pista en la imagen estéreo, en este caso 64 es el centro, 0 el margen izquierdo y 127 el derecho. Por último, Size nos indica el número de notas y eventos MIDI que existen en la pista.

Notas
Por lo pronto ya tenéis aquí información para poneros a andar con el Cakewalk. En breve añadiremos más cosas que se apartarán de lo básico, pero que resultarán muy útiles. Por otra parte, si te interesa saber algo sobre la sincronización del Cakewalk con otros dispositivos (como el Rebirth), tienes un tutorial en Web Studio.